Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ckap2lQ7TS74 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ckap2lQ7TS74 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms