Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LnpkQ7TQ95 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LnpkQ7TQ95 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms