Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf139Q7TMV1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms