Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms