Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SynmQ70IV5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms