Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms