Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcl3Q6W5C0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms