Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms