Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt3Q6PE13 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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