Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Zbtb40Q6PCS8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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Zbtb40Q6PCS8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Zbtb40Q6PCS8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Zbtb40Q6PCS8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Zbtb40Q6PCS8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Zbtb40Q6PCS8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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Zbtb40Q6PCS8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zbtb40Q6PCS8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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Zbtb40Q6PCS8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Zbtb40Q6PCS8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Zbtb40Q6PCS8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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