Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpbp1Q6NXH3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms