Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NipblQ6KCD5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NipblQ6KCD5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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