Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Carmil1Q6EDY6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Carmil1Q6EDY6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms