Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9bQ6EBV9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms