Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pram1Q6BCL1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms