Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rftn1Q6A0D4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms