Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cep290Q6A078 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cep290Q6A078 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cep290Q6A078 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cep290Q6A078 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cep290Q6A078 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Cep290Q6A078 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Cep290Q6A078 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cep290Q6A078 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cep290Q6A078 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cep290Q6A078 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cep290Q6A078 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cep290Q6A078 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep290Q6A078 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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