Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sh3rf1Q69ZI1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sh3rf1Q69ZI1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3rf1Q69ZI1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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