Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q66JV7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q66JV7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q66JV7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q66JV7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q66JV7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Q66JV7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Q66JV7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q66JV7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q66JV7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q66JV7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q66JV7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q66JV7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q66JV7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q66JV7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q66JV7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q66JV7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q66JV7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q66JV7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q66JV7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q66JV7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q66JV7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms