Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Knl1Q66JQ7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Knl1Q66JQ7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Knl1Q66JQ7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Knl1Q66JQ7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Knl1Q66JQ7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Knl1Q66JQ7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Knl1Q66JQ7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Knl1Q66JQ7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Knl1Q66JQ7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Knl1Q66JQ7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Knl1Q66JQ7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Knl1Q66JQ7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Knl1Q66JQ7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Knl1Q66JQ7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Knl1Q66JQ7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms