Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctnna3Q65CL1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms