Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprdQ64487 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PtprdQ64487 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PtprdQ64487 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PtprdQ64487 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PtprdQ64487 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PtprdQ64487 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PtprdQ64487 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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PtprdQ64487 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtprdQ64487 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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