Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt12Q64291 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt12Q64291 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms