Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Zfp248Q640N4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp248Q640N4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms