Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Col4a5Q63ZW6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms