Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp1Q62209 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sycp1Q62209 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms