Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd180Q62192 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms