Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Odf1Q61999 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms