Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hes3Q61657 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms