Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Msi1Q61474 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms