Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms