Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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Prpf4bQ61136 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prpf4bQ61136 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
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