Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lamb3Q61087 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lamb3Q61087 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms