Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

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Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp17laQ61068 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp17laQ61068 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp17laQ61068 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp17laQ61068 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp17laQ61068 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp17laQ61068 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp17laQ61068 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp17laQ61068 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129 ms