Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim1Q61045 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms