Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DbpQ60925 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms