Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurod1Q60867 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurod1Q60867 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms