Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc6a4Q60857 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc6a4Q60857 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms