Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HellsQ60848 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HellsQ60848 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HellsQ60848 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms