Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mkrn3Q60764 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms