Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms