Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc5a6Q5U4D8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms