Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r195Q5SVD6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms