Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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