Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps41Q5KU39 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms