Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

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Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp28Q5I043 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp28Q5I043 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp28Q5I043 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp28Q5I043 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp28Q5I043 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp28Q5I043 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp28Q5I043 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp28Q5I043 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Usp28Q5I043 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Usp28Q5I043 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Usp28Q5I043 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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