Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG9

Znf488, Zinc finger protein 488, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf488Q5HZG9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Znf488Q5HZG9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf488Q5HZG9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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