Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf3Q5HZG4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms