Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ecm2Q5FW85 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ecm2Q5FW85 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms