Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nlrc3Q5DU56 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nlrc3Q5DU56 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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